色譜工作站的硬件由微型計算機和接口組成，目前市場上普通的微型計算機即能滿足色譜工作站的配置要求；色譜工作站的軟件已不再局限于結果處理和分析，而可以控制色譜儀的各種程序動作。一般色譜工作站主要具備以下功能。1.自行診斷功能
可對色譜儀的工作狀態進行自我診斷，并能用模擬圖形顯示診斷結果，可幫助色譜工作者及時判斷儀器故障并予以排除。
2.全部操作參數控制功能
色譜儀的操作參數，如柱溫、流動相流量、梯度洗脫程序、檢測器靈敏度、最大吸收波長、自動進樣器的操作程序、分析工作日程等，全部可以預先設定，并實現自動控制。
3.智能化數據處理和譜圖處理功能
可由色譜分析獲得色譜圖的各個參數值，包括色譜峰的保留時間、峰面積、峰高、半峰寬和色譜柱的柱效、分離度、拖尾因子等，并可按歸一化法、內標法、外標法等進行數據處理，打印出分析結果。譜圖處理功能包括譜圖的放大、縮小，峰的合并、刪除、多重峰的疊加等。
4.進行計量認證的功能
工作站儲存有對色譜儀器性能進行計量認證的專用程序，可對色譜柱控溫精度、流動相流量精度、氘燈和氙燈的光強度及使用時間、檢測器噪聲、自動進樣器的線性等進行監測，并可判定是否符合計量認證標準。
此外，色譜工作站還具有控制多臺儀器的自動化操作功能、網絡運行功能，還可運行多種色譜分離優化軟件、多維色譜系統操作參數控制軟件等，詳細情況可參閱有關專著。
總的說來，色譜工作站的出現，不僅大大提高色譜分析的速度，也為色譜分析工作者進行理論研究、開拓新型分析方法創造了有利的條件。可以預料，隨著電子計算機技術的迅速發展，色譜工作站的功能也會日益完善。
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